Aminosyror
Rita en vätebindning som förekommer mellan R-grupper i proteiner. Ange vilka atomer som är donator respektive acceptor i bindningen samt vilka aminosyror som ingår.
Tacksam för hjälp med svar på ovanstående.
Välkommen till Pluggakuten!
Hur långt har du kommit själv med frågan? Kan du hitta några aminosyror som kan bilda vätebindingar med varandra?
Jag har lärt mig att rita upp alla 20 aminosyror, deras strukturformler samt deras olika kategoriseringar.
Förstår dock inte denna fråga om jag ska rita en vätebindning mellan R-gruppernas kedjor. Innebär det att jag kan rita en bindning mellan aminogruppen i en aminosyra och mellan karboxylgruppen i en annan aminosyra?
Nej, alla aminosyror har en karboxyl- respektive en aminogrupp.
R-gruppen avser den för varje sort av aminosyra individuella sidokedjan, d.v.s den del som skiljer aminosyrorna från varandra.
Vissa av dessa sidokedjor han delta i vätebindningar, och då finns en vätebindningsdonator i en sidokedja och en motsvarande vätebindingsacceptor i en annan sidokedja.
Har du något exempel på två aminosyror?
Det finns 20 stycken att välja på, kolla wikipedia för deras strukturer och egenskaper.
Börja med att rita upp två som kan vätebinda, och sedan kan du börja klura ut vilken som är donator respektive acceptor för vätebindingen.
Kanske Lysin som är positivt laddad - proponerad med Glutamat som är negativt laddad deprotonerad?
Ja de två aminosyror skulle kunna vätebinda. Rita och visa, vätebindning, donator/acceptor.
När dessa aminosyror ingår i protein kan de även ge upphov elektrostatiska interaktioner, t.ex. saltbryggor. Detta då deras laddningar är motsatta. För att skilja om det är fråga om en vätebinding eller en saltbrygga i proteinet får man titta på omgivningen och avståndet mellan NH3 och COO- grupperna - där saltbryggans interaktion kan vara lite längre (upp till 4 Ångström) mot vätebindningens 2.8-3 Ångström.
