Enzymet katalas i sur/basisk lösning
Jag undrar varför enzymaktivtetet hos katalas fungerar någorlunda bra i basisk miljö (natriumhydroxidlösning), men inte i sur miljö (saltsyralösning). Enzymet verkar ha dentunerat i saltsyralösningen, men inte i natriumhydroxidlösningen fastän att enzymet katalas fungerar optimalt i pH 7-8, och att pH är högre än 7-8 i natriumhydroxidlösningen.
Vilket intervall av pH som ett enzym är som mest aktivt, och vilket pH intervall som enzymet tolererar (d.v.s. då det inte denaturerar), beror på vilket enzymet är. Och även för ett och samma enzym, som katalas, skiljer sig pH intervallet t.ex. mellan olika organismer.
Vilken var källan till det katalas ni använde? Kanske gris eller ko?
mag1 skrev:Vilket intervall av pH som ett enzym är som mest aktivt, och vilket pH intervall som enzymet tolererar (d.v.s. då det inte denaturerar), beror på vilket enzymet är. Och även för ett och samma enzym, som katalas, skiljer sig pH intervallet t.ex. mellan olika organismer.
Vilken var källan till det katalas ni använde? Kanske gris eller ko?
Det var från en potatis som vi använde.
Ett vanligt sätt att studera enzym, är att följa enzymaktiviteten vid olika pH och temperaturer. Vissa organismer producerar och använder sin version av enzymet inom ett visst pH intervall, och temperaturintervall. Och dessa intervall skiljer oftare mer mellan arter som är olika (t.ex. människa och potatis), och är oftare lika för arter som är mer lika (t.ex. människa och gris).
Generellt så kan det intervall där enzymer är aktiva beskrivas som med klockform, där den maximala aktiviteten finns i mitten av det pH intervall där enzymet är aktivt. Motsvarande röda linjen i bilden nedan, där enzymets aktivitet ses på y-axeln mot pH på x-axeln.
För "enzyme" i rött är aktiviteten högst vid pH 8, vilket är enzymets otimala pH. Vid lägre respektive högre pH är enzymet fortfarande aktivt, men inte lika mycket. När pH avviker för mycket kommer proteinet denaturera, och under pH 3 eller över 12 finns i princip ingen enzymaktivitet, för allt protein har denaturerat.
Detta pH beroende gäller generellt för enzymer, men hur det är för just ditt katalas från potatis vet jag ej. "Catalase" i diagrammet, blå linjen tror jag motsvara katalaset i vår lever, så inte precis ditt potatiskatalas, men liknande.
Att ditt katalas fungerar i aningen basisk miljö, stämmer nog med enzymets pH tolerans, som från dina resultat inte verkar inkludera surt pH men aningen basiskt pH.
mag1 skrev:Ett vanligt sätt att studera enzym, är att följa enzymaktiviteten vid olika pH och temperaturer. Vissa organismer producerar och använder sin version av enzymet inom ett visst pH intervall, och temperaturintervall. Och dessa intervall skiljer oftare mer mellan arter som är olika (t.ex. människa och potatis), och är oftare lika för arter som är mer lika (t.ex. människa och gris).
Generellt så kan det intervall där enzymer är aktiva beskrivas som med klockform, där den maximala aktiviteten finns i mitten av det pH intervall där enzymet är aktivt. Motsvarande röda linjen i bilden nedan, där enzymets aktivitet ses på y-axeln mot pH på x-axeln.
För "enzyme" i rött är aktiviteten högst vid pH 8, vilket är enzymets otimala pH. Vid lägre respektive högre pH är enzymet fortfarande aktivt, men inte lika mycket. När pH avviker för mycket kommer proteinet denaturera, och under pH 3 eller över 12 finns i princip ingen enzymaktivitet, för allt protein har denaturerat.
Detta pH beroende gäller generellt för enzymer, men hur det är för just ditt katalas från potatis vet jag ej. "Catalase" i diagrammet, blå linjen tror jag motsvara katalaset i vår lever, så inte precis ditt potatiskatalas, men liknande.
Att ditt katalas fungerar i aningen basisk miljö, stämmer nog med enzymets pH tolerans, som från dina resultat inte verkar inkludera surt pH men aningen basiskt pH.
Ska jag räkna ut pH som finns i blandningen jag har testat?
Ska jag räkna ut pH som finns i blandningen jag har testat?
Nej det ser jag inget syfte i att räkna ut. Om du t.ex. testat pH med teststickor eller lackmuspapper så vet du redan vad pH är på ett ungefär.
Är du med på hur det kan komma sig att katalaset fungerade vid högre pH men inte vid lägre (d.v.s. det du frågade om)?
mag1 skrev:Ska jag räkna ut pH som finns i blandningen jag har testat?
Nej det ser jag inget syfte i att räkna ut. Om du t.ex. testat pH med teststickor eller lackmuspapper så vet du redan vad pH är på ett ungefär.
Är du med på hur det kan komma sig att katalaset fungerade vid högre pH men inte vid lägre (d.v.s. det du frågade om)?
Nej vi har inte testat pH på blandningarna. Men jag hänger inte riktigt med på varför katalas fungerar för högre pH än 7 men inte lägre.
Katalasets enzymaktivitet (som gör att det "fungerar" som du skrev) påverkas av pH. När aminosyrans sidokedjor tar upp en proton eller protolyseras, så ändras bindningarna en aning till/från sidokedjan. Och detta påverkar proteinet lite lite lite, så om det sker en mindre förändring påverkas inte proteinet som helhet, så mycket. Men ju mer detta sker desto mer påverkas enzymet, och till slut denaturerar proteinet.
Hur stora skillnader i pH (upp respektive ner) ett protein klarar av, beror helt på vilket protein det är. Så med det katalas du undersökt tål det högre pH bättre än lägre- Och sker just därför att proteinet som helhet ändras mer när pH sjunker under 7, och mindre när pH ökar en aning. Det kan till och med vara så att just det katalasenzymet ni undersökt, har en kritisk gräns vid pH 7 (precis som i bilden jag klistrade in).
