Hur man vet vilken primer som ska användas vid PCR
Hur vet man vilken primer som ska användas vid PCR? Alla har ju olika DNA, så hur vet man vilken primer (alltså vilka nukleotider som ska finnas där i) som ska användas? Då måste man väl känna till en sekvens av DNA:t som ska analyseras, och det gör man väl ej, för varför skulle man då behöva utföra PCR?
Så vilken sekvens du väljer för din primer beror på vad du vill studera. Det går även att skapa korta primrar som inte binder så specifikt, för att amplifiera okänt DNA för t.ex. DNA-sekvensering.
Primerns sekvens måste vara komplementär till den biten av DNA som du vill amplifiera, så ja du behöver veta en bit av sekvensen för DNA-biten du vill amplifiera med PCR.
Och det stämmer vi har olika DNA, nästa alla (inte enäggstvillingar de har samma). Men vi delar även på samma gener, för t.ex. ämnesomsättningen, celldelningen etcetera. Små variationer finns så klart annars skulle vi vara både lika och inavlade. Men de gener som jag behöver för att leva och fortplanta mig är samma som någon annan med samma kön.
Variationerna är små mutationer t.ex. så kallade enbaspolymorfier (eller SNP på engelska, kallas "snipps") som kan analyseras med hjälp av PCR, vilket har skett och sker vid t.ex. kriminalteknik (säkrade DNA-spår matchas mot en misstänkt).
Jag tolkar det som att du pratar om sekvenstering av människo DNA? För vilket syfte?
I mänskligt genom finns segment som är 'preserved', alltså konstanta, dessa kan man skapa primers för.
Edit: ojdå, jag satt och skrev för länge, såg inte ditt svar mag1
