6 svar
248 visningar
Roma behöver inte mer hjälp
Roma 70
Postad: 26 jan 2019 18:08

Laddning på protein

Hur kan man se om ett protein är negativ eller postitiv? Vad är det man tittar efter? 

stupidugly 159 – Fd. Medlem
Postad: 26 jan 2019 18:31

Man kollar på summan av laddningarna på aminosyrornas sidokedjor samt proteinets C- och N-terminaler.

Roma 70
Postad: 26 jan 2019 18:48

Man tittar alltså på aminosyrasekvensen och räknar hur många negativa resp positiva aminosyror det är? 

Hur kan man kolla på C och N terminalen? Förstod inte riktigt där och du får gärna utveckla

stupidugly 159 – Fd. Medlem
Postad: 26 jan 2019 19:13

Precis, så t.ex: Om vi har en "minipeptid" med Lys-Asp har den en neutral laddning, eftersom (+1) + (-1) = 0.

 

Terminalerna har en neutral laddning som zwitterjon(vid pH7):

O-OC-Cα-NH3+

Vid lågt pH protoniseras aminosyran och får en positiv laddning:

HOOC-Cα-NH3+

Vid högt pH deprotoniseras aminosyran och får en negativ laddning:

O-OC-Cα-NH2

 

Läs mer om isoelektrisk punkt så blir det nog lite klarare, även om det kan se lite krångligt ut så räcker det långt om man förstår grundprincipen.

Roma 70
Postad: 26 jan 2019 19:38

Tack förstod bättre nu :)

men om terminalerna är alltid neutrala så är det aminosyrasekvensen som avgör då behöver man ju inte titta på terminalerna? 

Smaragdalena 80504 – Avstängd
Postad: 26 jan 2019 19:46

Terminalerna är inte alltid neutrala - det beror på omgivningens pH. Dessutom kan det finnas sura och/eller basiska sidokedjoer på vissa aminosyror.

stupidugly 159 – Fd. Medlem
Postad: 26 jan 2019 19:53

Är de alltid neutrala?

De finns sura miljöer även i biologiska system, magsäcken och lysosomen t.ex.

Svara
Close