Piptidbindning 3
Min lärare vill att vi ska skriva c-terminal som COO- och N-terminal som NH3+, då blir jag lite förvirrad om hur ska piptidbindning se ut och även andra aminogrupper i sidokedja, blir det rätt så här vid PH 5? 
Kan du rotera bilden så den hamnar rätt, så vi slipper rotera på datorn.
Bilden roterad. /moderator
Den ser ut att den är redan roterad på min mobil, ska jag ta bilden igen ?
Teraeagle roterade bilden åt dig, för oss andra.
I peptidbindningen brukar karbonylgruppens syre, ritas med dubbelbindningen rakt upp. Annars ser det rätt ut. Den enda sidokedjan som finns är arginins, som vid pH 5 har tagit upp en proton och fått laddningen +1, precis som du skrivit ut.
Stämmer det rätt att kväve i piptidbindning får två väte? Eller blir ett väte bara?
Generellt ska man ändra på sidokedja genom att t.ex tar bort ett väte eller läger till vid olika PH värde? Eller är det bara att räkna om det är positiv eller negativ utan att ändra ?
Bosolaeter skrev:Stämmer det rätt att kväve i piptidbindning får två väte? Eller blir ett väte bara?
Nej, missade att kommentera på det. Kväveatomen i peptidbindningen (med "e" inte "i", förresten) har endast ett väte, och är då helt oladdad.
Bosolaeter skrev:Generellt ska man ändra på sidokedja genom att t.ex tar bort ett väte eller läger till vid olika PH värde? Eller är det bara att räkna om det är positiv eller negativ utan att ändra ?
Du kan göra det som fungerar bäst för dig. Men ändringen av laddningen uppstår då en proton tas upp eller lämnar.
