Vartifrån kommer elektronerna?

I denna video förklara han att de orangea elektronerna tillkommer för att skapa ädelgasstruktur. Men var kommer de ifrån? För i sådant fall måste de väl komma från en annan atom och då måste det ju tillkomma ett ämne i molekylformeln? 

Redigering: 

Hur vet man att detta är en jon? Varför är det inte en molekyl? Den sitter ju ihop med ett annat ämne?