5 svar
289 visningar
Roma är nöjd med hjälpen
Roma 70
Postad: 15 jul 2019 20:30

extinktionskoefficient

Någon som vet varför vissa proteiner har två extinktionskoefficient?

Smaragdalena Online 78528 – Lärare
Postad: 15 jul 2019 21:03

Gissningsvis gäller de vid olika våglängder. Hemoglobin har exempelvis olika färg om det är "tomt" eller syremättat.

Kan du ge lite mer bakgrundsfakta?

Roma 70
Postad: 15 jul 2019 23:17

 

Det handlar om proteinet retinolbindande protein  

 Number of amino acids: 201 
Molecular weight: 23038.8 
Theoretical pI: 5.41 
Amino acid composition: 

Ala (A)  19      9.5% Arg (R)  13       6.5% Asn (N)   9       4.5%
Asp (D)  18      9.0% Cys (C)   6       3.0% Gln (Q)   9       4.5%
Glu (E)  11      5.5% Gly (G)  12       6.0% His (H)   4       2.0%
Ile (I)   6      3.0% Leu (L)  15       7.5% Lys (K)  11       5.5%
Met (M)   5      2.5% Phe (F)  11       5.5% Pro (P)   4       2.0%
Ser (S)  12      6.0% Thr (T)   9       4.5% Trp (W)   6       3.0%
Tyr (Y)   8      4.0% Val (V)  13       6.5% Pyl (O)   0       0.0%
Sec (U)   0      0.0%     (B)   0       0.0%     (Z)   0       0.0%
    (X)   0      0.0%
  Total number of negatively charged residues (Asp + Glu): 29
Total number of positively charged residues (Arg + Lys): 24 
Atomic composition:  Carbon      C          1020 Hydrogen    H             1547 Nitrogen    N            283 Oxygen      O              307 Sulfur
     S          11 
Formula: C1020H1547N283O307S11
Total number of atoms: 3168 
Extinction coefficients: 
Extinction coefficients are in units of  M-1 cm-1, at 280 nm measured in water. 
Ext. coefficient    45295 Abs 0.1% (=1 g/l)   1.966, assuming all pairs of Cys residues form cystines  
Ext. coefficient    44920 Abs 0.1% (=1 g/l)   1.950, assuming all Cys residues are reduced 

Smaragdalena Online 78528 – Lärare
Postad: 16 jul 2019 00:29

Det står ju klart och tydligt vad det är för skillnad:

Extinction coefficients are in units of M-1 cm-1, at 280 nm measured in water.
Ext. coefficient 45295 Abs 0.1% (=1 g/l) 1.966, assuming all pairs of Cys residues form cystines
Ext. coefficient 44920 Abs 0.1% (=1 g/l) 1.950, assuming all Cys residues are reduced

Roma 70
Postad: 16 jul 2019 00:44

Ok trodde inte att det har var anledningen. Tänk att vissa tenta frågor kan vara så enkla! 

Smaragdalena Online 78528 – Lärare
Postad: 16 jul 2019 09:21

Läsförståelse är en grundläggande kunskap, även på universitetsnivå.

Svara Avbryt
Close