Isoelektrisk punkt, pH och amino syrors laddning

Därför att Ip definieras som det pH-värde där aminosyran är oladdad, d v s där aminosyran är protonerad till 50 %. För de aminosyror som inte har någon extra syra-eller aminogrupp betyder det att aminosyran är en zwitterjon, alltså att den är en syra i ena änden (den protonerade amingruppen kan avge en proton) och en bas i andra änden (den deprotonerade syran kan ta upp en proton). Om pH är lägre än Ip, kommer aminosyran att vara protonerad till mer än 50 % (en del av molekylerna har fått sin syra-ände protonerad), så aminosyran kommer att var positivt laddad. För pH högre än Ip fungerar det likadant fast tvärtom..